16.09.2024

Doktorand (m/w/d) Bioinformatik und Informatik

Forschungszentrum Borstel, Leibniz Lungenzentrum (FZB), Borstel

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/n

Doktorand (m/w/d)

auf dem Gebiet der Bioinformatik und Informatik aus.

Die Stelle (65%) ist auf drei Jahre befristet.

Das Forschungszentrum Borstel ist das Lungenzentrum in der Leibniz Gemeinschaft. Wir sind ein international agierendes, von Bund und Ländern finanziertes Wissenschaftsunternehmen. Unsere zentrale Aufgabe ist die Grundlagen- und translationale Forschung auf dem Gebiet der Atemwegserkrankungen. Wir betreiben umfangreiche Labor- und Forschungsinfrastrukturen. Akademisch sind wir mit den benachbarten Universitäten und klinisch mit dem Universitätsklinikum Schleswig-Holstein eng verbunden. Wir haben ein Ziel: Bestehende Methoden zur Erkennung, Vermeidung und Behandlung von Lungenerkrankungen zu verbessern und neue, innovative Therapieansätze zu entwickeln.

STELLENBESCHREIBUNG

Das Projekt widmet sich der Weiterentwicklung von Software für die Lipidomforschung im Rahmen des Projektes: Lipidomics Informatics for Life Sciences (LIFS - www. lifs-tools.org). Der/die Bewerber/in ist verantwortlich für die Implementierung und Wartung von Software des Konsortiums mit dem Schwerpunkt in der massenspektrometriebasierten Datenverarbeitung in Lipidomics und unterstützt die Lehrtätigkeit innerhalb des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik (de.NBI). Das Promotionsprojekt wird sich auf die Integration von Ionenmobilität in der automatisierten Lipididentifizierung sowie die Implementierung von Metriken der Datenqualität auf Basis der LipidXplorer-Plattform konzentrieren.

IHRE KOMPETENZEN

  • MSc, BSc in Informatik, Bioinformatik und Computerwissenschaften
  • Erfahrung mit LC-MSn basierter Omics Datenverarbeitung
  • Erfahrung in der Programmierung von Python, R und Shiny
  • Erfahrung in der multivariaten Datenanalyse und Statistik
  • Erfahrung in der Cheminformatik wäre von Vorteil
  • Gute Kommunikationsfähigkeiten in englischer Sprache in Wort und Schrift

UNSER ANGEBOT

  • Arbeiten in einem renommierten Lungenforschungszentrum vor den Toren Hamburgs
  • Ein eigenverantwortlicher Arbeitsbereich innerhalb eines motivierten Teams
  • Vergütung nach dem TVöD-VKA einschließlich aller im öffentlichen Dienst üblichen Leistungen
  • Familienfreundliche Arbeitsbedingungen und flexible Arbeitszeiten
  • Betriebliche Gesundheitsförderung

Das FZB ist für das Audit „berufundfamilie“ zertifiziert und fördert gezielt die Vereinbarkeit von Beruf und Familie. Das unterrepräsentierte Geschlecht wird bei gleicher fachlicher und persönlicher Eignung besonders berücksichtigt. Ebenso werden Schwerbehinderte bei sonst gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Weitere Informationen zu unserer Rekrutierungspolicy sowie unserer Zertifizierung „HR Excellence in Research“ finden Sie auf unserer Homepage. Bei Fragen steht Ihnen PD Dr. D. Schwudke unter dschwudke(at)fz-borstel gerne zur Verfügung. Bitte senden Sie Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen (ohne Foto) bis zum 15.10.2024 an unsere Website www.fz-borstel.de. Wir planen, die Stelle spätestens im Januar 2025 zu besetzen.